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新疆生產建設兵團總醫院正式成立于1982年，是一所集醫療、教學、科研、預防、保健、康復為一體的省級綜合性三甲醫院。醫院不僅承擔著兵團、自治區廣大人民群眾保健的任務，還擔負著兵團主要疑難危重疾病的診治和突發公共衛生事件的救治任務。幾十年的艱苦奮斗，兵團醫院譽滿天山，先后榮獲全國扶殘助殘先進單位，全國殘疾人三項康復工作先進單位，全國三甲醫院感染工作先進單位，全國優秀價格監測定點單位，連續五年榮獲自治區藥品價格定點監測先進單位一等獎、連續三年榮獲烏魯木齊市醫療保險優秀定點醫院和醫療保險先進單位，連續兩年榮獲優秀商業保險定點醫院,榮獲兵團、烏市文明單位等榮譽稱號 。
兵團醫院目前有國務院特殊津貼專家7人，教授、副教授38名，高級職稱121人，中級職稱209人，碩士生導師10人。有231人在國家、省、自治區、兵團各級學術團體、保健委員會中擔任主任委員、秘書長等，其中主任副主任委員25人、秘書長副秘書長4人、理事常委52人。醫院設有30多個臨床、醫技科室和20多個專科門診檢查、治療處室，是石河子大學醫學院第二附屬醫院、新疆醫科大學教學醫院。2005年到2010年上半年，醫院門診量平均增長速度為15.96%，出院病人數平均增長速度為16.97%，病床使用率已達115.19%，病床周轉次平均增長速度為15.67%，手術量平均增長速度為16.22%。醫院始終堅持“科學技術是第一生產力”，不斷加大技術創新力度。
兵團醫院在國內外刊物上發表學術論文600余篇，參加國際學術會議20余次，開展新技術、新項目300多項，獲得國家、自治區及兵團科技成果獎40多項。同時，醫院開展的腦癱患兒干細胞移植術、主動脈夾層支架植入術、肝臟良惡性腫瘤切除及射頻治療、胰頭癌十二指腸切除術、門脈高壓癥手術、肝包蟲外殼剝離術、陰式微創手術、綠激光治療前列腺增生、等離子體低溫組織消融術、髖、膝關節置換術及在導航下開展骨科復雜手術、超聲乳化加晶體植入術治療白內障、特色中西醫肛腸疾病的治療、小兒麻痹矯治手術、冠狀動脈搭橋術、心臟起搏器植入術、心臟瓣膜置換術、冠狀動脈支架置入術、射頻消融術、房間膈缺損封堵術、經尿道鏡氣壓彈道碎石術、腹腔鏡下交通支靜脈結扎術、椎間盤鏡微創治療腰椎間盤突出癥手術、靜脈溶栓、動脈溶栓、缺血性卒中急性期病因診斷、臨床分型及規范治療等一系列新技術、新項目。
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